เป็นวิธีการที่สกัดตัวยาออกจากพืชสมุนไพร ซึ่งเหมาะสำหรับพืชสมุนไพรที่มีสารสำคัญที่ไม่ละลายน้ำ นำมาสกัดโดย การแช่สมุนไพรสดหรือแห้งในเหล้าหรือแอลกอฮอร์ละลายสารสำคัญในสมุนออกมา เหล้าหรือแอกอฮอล์ที่ใช้ในการดอง นอกจากจะทำหน้าที่สกัดตัวยาจากสมุนไพร แล้วยังทำหน้าที่เป็นสารกันบูดได้อีกด้วย ยาดองจึงเก็บไว้ใช้ได้นานเป็นปีเลยทีเดียว

  วิธีเตรียมยา
          ส่วนใหญ่มักจะเป็นสมุนไพรแห้ง หั่นเป็นชิ้นๆ เหล้าหรือแอลกอฮอล์ที่นำมาใช้ในการดอง มักจะใช้เหล้าขาว 28-40 ดีกรี หรือเอทิล แอลกอฮอล์ (Ethyl Alcohol) ห้ามใช้เมทิล แอลกอฮอล์ (Methyl Alcohol) โดยเด็ดขาด เพราะเป็นพิษ กินไม่ได้ นอกจากใช้เหล้าและเอทิลแอลกอฮอล์ ยังสามารถใช้น้ำหมักจากผลไม้ หรือน้ำส้มสายชูในการดองยาก็ได้ แต่การสกัดตัวยาได้ไม่ดีเท่าเหล้าหรือแอลกอฮอล์ อายุการใช้รักษาก็สั้นกว่าแต่ราคาจะถูกกว่าการใช้เหล้า


  วิธีการดอง
          อาจจะใช้สมุนไพรดองในเหล้าโดยตรง หรืออาจจห่อสมุนไพรด้วยผ้าขาวบางแล้วดองด้วยเหล้าในขวดโหลแก้ว หรือโถกระเบื้อง เทเหล้าให้ท่วมห่อยา ปิดฝาให้สนิทตั้งทิ้งไว้ประมาณอย่างน้อย 1-2 สัปดาห์ และจะต้องเปิดฝาคนวันละ 1 ครั้ง เมื่อยาครบกำหนดแล้ว เทยาดองใส่ขวดหรือภาชนะสีทึบ บีบยาดองออกจากห่อผ้าขาวบางให้หมดปิดฝาให้สนิท